Omik, yaşayan sistemleri profillemek amacıyla oluşturulan kapsamlı yaklaşımlara verilen genel bir isimdir. Omik dünyasında üretilen veri miktarı çok büyüktür. Çok büyük veri setlerinin anlamlı bir şekilde görselleştirilmeleri bazı zaman zorlayıcı olabilmektedir. Veriyi daha iyi görselleştirmek ve sistemleri detaylıca inceleyebilmek için tek hücre verisi üretilir. Tek hücre verisi sistemdeki her hücreye ait gen ifade profillerini içermektedir. Bu yüzden, sistemleri tek hücre seviyesinde incelemek çok daha yararlıdır.

Kümeleme, tek hücre çalışmalarındaki en temel adımdır. Bu aşamada hücreler boyutu düşürülmüş uzaydaki gruplanmaları incelenerek çeşitleri belirlenir. Belirlenen hücre tipleriyle daha detaylı analizlere devam edilir. Kümelenme sonuçlarını incelerken; her kümenin birbirinden ayrıldığını görebilmek, farklı kümeleri karşılaştırmak ve bazı genlerin ifadelerini incelemek oldukça önemlidir. Tüm bunları tek bir yerde yapabilmek için, web tabanlı interaktif görselleştirme platformuna ihtiyaç vardır. Bu tür platformlar kullanılarak hücrelerin çeşitlerine göre renklendirilme, seçili hücreler arasında gen ifade analizi, kümeler arasındaki ifade farklılığını incelemek için gen seçimi ve veri setindeki diğer bilgileri inceleme gibi işlemler yapılabilir. Bu çalışmada interaktif görselleştirme yapabilen platformlar kullanılabilirlik, kullanıcı arayüzü, geliştirici desteği, farklı boyuttaki dosyalara göre performans gibi kriterler açısından incelenmiştir. Aynı zamanda bu platformlarda kullanılan dosya formatları incelenip karşılaştırılmıştır.

Details About the Webinar

Webinar ID: c358c8c1ccfd

About the Speakers

1648987214-1b8147bec0266c63 ISCB SC RSG Turkey

ISCB RSG Turkey Crew

Open-uri20140128-756-1rinqkz Melike Dönertaş


B Batuhan Cakir


Full name*
Email Address*
We use BigMarker as our webinar platform. By clicking Register, you acknowledge that the information you provide will be transferred to BigMarker processing in accordance with their Terms of Service and Privacy Policy.